L’Assemblée Générale réunit des personnalités et institutions de premier plan pour approuver les grandes orientations, le budget et la stratégie globale de l’UEMF.
L’Assemblée Générale (AG) est le plus haut organe souverain de l'UEMF. Elle est présidée par le Chancelier, nommé par SM Le Roi, et se réunit au moins une fois par an et autant que de besoin, pour approuver les activités de l'UEMF et le budget, décider le cas échéant des actes touchant au patrimoine de l'université, décider d'engager une action en justice, ou encore pourrenouveler,les cas échéants, les mandats des membres duConseil d’Orientation, de Surveillance et de Développement(COSD), appelé aussi Conseil d’Administration.
L’AG se réunit éventuellement en session extraordinaire (AGE) pour traiter de questions urgentes et de grande importance, telles que : i) l’amendement et la modification des Statuts, ii) l'application d'orientations nouvelles, ou iii) le cas échéant la dissolution de la Fondation.
Le Chancelier de l’UEMF
Le Président de l’UEMF
Le Ministre de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche Scientifique, et de l’Innovation
Le Ministre de l’Éducation Nationale, du Préscolaire et des Sports
Le Ministre des Affaires Étrangères, de la Coopération africaine et des Marocains résidant à l'Étranger
Le Ministre de l’Économie et des Finances
Le Secrétaire Général de l'Union pour la Méditerranée (UpM)
Le Secrétaire Perpétuel de l’Académie Hassan II des Sciences et Techniques
Le Wali de la Région Fès-Meknès
Le Président de la Région Fès-Meknès
Le Maire de la ville de Fès
Le Président de la CGEM
Le Président de la Conférence des Présidents d'Université du Maroc (CPU)
Le Recteur de l’Institut Royal de la Culture Amazighe
Le Président de l’Université EMUNI de Slovénie
Le Secrétaire Général des Universités, Ministère de l’Éducation, de la Culture et des Sports de l’Espagne.